Während der NS-Zeit wurden an der Freiburger Universität auch ideologische Fächer eingeführt. Missliebige Studierende und Lehrende wurden aus rassistischen und politischen Gründen der Universität verwiesen - Propaganda gehörte zum Alltag.
Durch die Kriegseinwirkungen wurde auch die Universität in weiten Teilen stark zerstört. Voraussetzung für eine Immatrikulation war die Beteiligung am Wiederaufbau der Universität.